Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vps4aQ8VEJ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vps4aQ8VEJ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps4aQ8VEJ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps4aQ8VEJ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vps4aQ8VEJ9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms