Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc115Q8VE99 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms