Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhovQ8VDU1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhovQ8VDU1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms