Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx7Q8VDS3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms