Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d2Q8VD57 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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