Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt25Q8VCW2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms