Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc2Q8VBV3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms