Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top1mtQ8R4U6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1mtQ8R4U6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1mtQ8R4U6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1mtQ8R4U6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top1mtQ8R4U6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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