Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mterf3Q8R3J4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf3Q8R3J4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms