Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc12Q8R344 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms