Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r200Q8R281 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r200Q8R281 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms