Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf183Q8QZS5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rnf183Q8QZS5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf183Q8QZS5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf183Q8QZS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf183Q8QZS5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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