Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc12Q8K5B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms