Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abca9Q8K449 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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Abca9Q8K449 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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Abca9Q8K449 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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Abca9Q8K449 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Abca9Q8K449 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms