Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casc3Q8K3W3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms