Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxn4Q8K3Q3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms