Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sash3Q8K352 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sash3Q8K352 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms