Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssh3Q8K330 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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