Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 910.5 ms