Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr3Q8K296 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mtmr3Q8K296 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms