Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sde2Q8K1J5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms