Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgbQ8K0E8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgbQ8K0E8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms