Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8K039 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8K039 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8K039 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8K039 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8K039 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8K039 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8K039 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8K039 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q8K039 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q8K039 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q8K039 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8K039 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8K039 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8K039 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8K039 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8K039 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8K039 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8K039 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8K039 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8K039 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8K039 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8K039 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8K039 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms