Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mterf1aQ8CHZ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mterf1aQ8CHZ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms