Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip3Q8CHD8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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