Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SltmQ8CH25 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SltmQ8CH25 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SltmQ8CH25 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms