Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp2Q8CGR7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms