Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp1Q8CG19 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp1Q8CG19 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp1Q8CG19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms