Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp11Q8CFF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms