Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ercc8Q8CFD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ercc8Q8CFD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ercc8Q8CFD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ercc8Q8CFD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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