Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup88Q8CEC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup88Q8CEC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup88Q8CEC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms