Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramef8Q8CE24 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef8Q8CE24 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef8Q8CE24 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms