Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.6 ms