Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms