Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms