Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf2Q8CB19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Phtf2Q8CB19 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf2Q8CB19 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms