Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spef2Q8C9J3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spef2Q8C9J3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spef2Q8C9J3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms