Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms