Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6U3

Gm17334, Predicted gene, 17334, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17334Q8C6U3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17334Q8C6U3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17334Q8C6U3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms