Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cwc22Q8C5N3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms