Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssuh2Q8C3L1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms