Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21aQ8C0S4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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