Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Iffo1Q8BXL9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Iffo1Q8BXL9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms