Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx1bQ8BX32 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms