Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp5Q8BX09 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp5Q8BX09 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms