Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pggt1bQ8BUY9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pggt1bQ8BUY9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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