Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bicd1Q8BR07 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bicd1Q8BR07 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms