Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Larp6Q8BN59 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Larp6Q8BN59 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Larp6Q8BN59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms