Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd55Q8BLD6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms