Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zcchc4Q8BKW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zcchc4Q8BKW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms